能肯定指示水柱城化或还原条件的化学化石,现在尚不知道,但总的来说,不稳定的脂在还原环境里显著地保存较好。
二、原油勘探
沉积岩和石油中化学化石的分布可以反映沉积环境和由热力引起的晚期成岩作用和后生作用的性质与程度,因此它们在地球化学对比研究中有明显的价值。对于原油,还必须了解它们在储集岩中的生物降解和运移的影响。化学化石的最初应用是用简单对比图形相似性来对比原油和生油岩。

如果两个原油和设想的生油岩样品有不同沉积环境和不同成熟度,就不能期望原油中的化合物分布与设想的生油岩的化合物分布能对比得上。石油地质家对于对比不好的原因显然是十分感兴趣的。
了解晚期成岩作用和后生作用期菌体化合物的命运的近期进展,已提出用侧量一些选择的产物和前身物的比值作评价热成熟度的方法。此方法已用于几种化合物。
把化学化石应用于石油地球化学,还应把生油岩中成熟作用的结果与储集岩成熟作用的结果区分开,然后来评价这些作用的相对程度,这就要寻找一些反应,即寻找能够在油离开生油岩进入储集岩成为流体时有效停止的反应甚至当生油岩和储集岩有相同温度时,和在生油岩和储集岩两者中可能以不同速率进行的反应。
对于原油和可能生油岩、原油和原油以及由沉积环境差异造成的沉积物之闻的对比,要识别它们的不足之处是较困难的。许多原始的分子随着热成熟作用而消失。
在进行沉积环境的这方面评价时,须当心,特别是因为使用的物质小于生油岩中总有机碳的5%,而且生油岩与石油中生物标志物含里常常很少,然而正是这些结构上特别的化合物表明,由它们可以得到一种不受成熟度影响的原始生物愉入的分子记录。
运移可能对石油中化学化石分布有形响,对这个问题搞不清楚的主要原因是缺乏对运移的机理和途径的了解。运移中的色层作用被认为是引起街烷立体异构体比值和其他烷烃相对丰度小量变化的原因。

在某些运移历史比较了解的原油中广从分子形状、大小和极性不同的化合物如单、三芳香幽烃,或者烷烃和芳香烃比值中可推洲运移程度引起的化合物变化,然而在运移情况下,烷烃立体异构体比值不受影响。影响原油组成的另一因素是储集岩中的生物降解作用。
三、环境应用
用化学化石的分布鉴定原油污染源的情况逐渐增多,因为它们使原油有一个“指纹”。原油自从滋出后,其组成受到三个主要作用影响,即光学氧化作用、挥发物的蒸发和细茵降解夕与其他许多烷烃相比,甾烷不易挥发,并且不能很快受生物降解,因此它们比较有抗拒这些风化作用的能力。
由色谱-质谱得到的这些化合物的分布确实为对比风化油苗和其可能的油源提供了一个最有效的方法,这止如色一质得到的化含物分布被广泛地用于对比储集岩中生物降解的石油和其未经降解的原油一样。
例如,在采用此方法指示现代沉积物污染源时,必须小心区别由成熟的富含有机质的贝岩产生的化合物,因为它们对现代污染的程度会给出假象。与此相似,共有大量外来有机质和运入烃的沉积岩,成熟度可能表现异常的高,这种影响有时可以从沉积物中共同存在不同成热度化合物的情况识别出来。
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